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VASP

VASP是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。

注意事项： VASP 为商业软件，无法在应用中心直接搜索使用，需要向软件厂商购买授权使用，如需使用集群上的 VASP，需要向销售经理充分沟通，并附上购买 VASP 的许可证明。

一. 模板提交​

Step 1. 在应用中心搜索VASP软件，申请后请联系客服同意,部分软件无需申请，可直接提交作业；

Step 2.选择可视化模板提交；

Step 3. 点击输入文件列表上传文件，必须至少包含INCAR文件；

Step 4. 选择硬件配置；

  • 节点数量：设置启动多少个并行计算的计算节点。

  • 内存配比：设置各个计算节点内存大小为单节点核心数×内存配比。

Step 5. 查看作业内容汇总，并提交作业；

Step 6. 通过作业管理查看运行中的作业；

二. 命令行提交​

通过SSH连接创建并连接管理节点。

Step 1. 创建作业目录并进入；

mkdir vaspJob1
cd vaspJob1

Step 2. 通过文件传输上传所需的输入文件，详情请查看Linux数据传输；

Step 3. 在该文件夹下创建如下执行脚本vasp.sh：

#!/bin/bash
module add vasp/6.3.0+VTST+vtstscripts
ulimit -s unlimited
ulimit -l unlimited
mpirun vasp_std

Step 4. 提交作业；

2个4核心节点启动8个并行任务。

sbatch -N 2 -p c-64-2 -n 128 -c 1 vasp.sh

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看slurm命令。

结果文件下载请查看Linux数据传输。

点击下载以上作业样例：VASP.zip