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TeraChem

TeraChem 是第一个完全从头开始受益于GPU等新型流处理器的计算化学软件。计算算法完全是为了充分利用Nvidia CUDA GPU的巨大重叠而设计的。

一. 命令行提交​

通过SSH连接创建并连接管理节点。

Step 1. 创建作业目录并进入；

mkdir terachemJob1
cd terachemJob1

Step 2. 通过文件传输上传输入文件start.sp、complex.xyz，详情请查看Linux数据传输；

Step 3. 在该文件夹下创建如下执行脚本terachem.sh：

#!/bin/bash
source /public/software/.local/easybuild/software/terachem/terachem1.9/TeraChem/SetTCVars.sh
/public/software/.local/easybuild/software/terachem/terachem1.9/TeraChem/bin/terachem  start.sp

Step 4. 使用sbatch命令提交作业；

提交任务到带有一张T4卡的GPU节点运行。

sbatch -p g-t4-1 -N 1 -n 1 terachem.sh

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看slurm命令。

结果文件下载请查看Linux数据传输。