CP2K

CP2K是一个量子化学和固态物理软件包，可以对固态，液态，分子，周期性，材料， 晶体和生物系统进行原子模拟。CP2K为不同的建模方法提供了通用框架。支持的理论 水平包括DFTB，LDA，GGA，MP2，RPA，半经验方法（AM1，PM3，PM6，RM1， MNDO等）和经典力场（AMBER，CHARMM等）。CP2K可以使用NEB或二聚体方法 进行分子动力学，元动力学，蒙特卡洛，埃伦菲斯特动力学，振动分析，核心能谱， 能量最小化和过渡态优化的模拟。

一. 命令行提交步骤

通过SSH连接创建并连接管理节点。

Step 1. 创建作业目录并进入；

mkdir cp2kJob1
cd cp2kJob1

Step 2. 通过文件传输上传所需的输入文件，详情请查看Linux数据传输；

Step 3. 在该文件夹下创建如下执行脚本cp2k.sh：

#!/bin/bash
module add CP2K/2023.1-foss-2021a
mpirun -mca btl_tcp_if_include eth0 cp2k.popt -i Ac.inp -o test.out

Step 4. 提交作业；

2个4核心节点启动8个并行任务。

sbatch -N 2 -p c-4-1 -n 8 -c 1 cp2k.sh

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看slurm命令。

结果文件下载请查看Linux数据传输。

点击下载以上作业样例：CP2K.zip