Gaussian

本示例说明如何在云超算平台上运行作业，平台目前支持两百多种软件，您可根据自己的需求选择自己所需的软件和计算文件；本次使用软件是以gaussian为例， Gaussian是一个功能强大的量子化学综合软件包。其可执行程序可在不同型号的大型计算机，超级计算机，工作站和个人计算机上运行，并相应有不同的版本。高斯功能：过渡态能量和结构、键和反应能量、分子轨道、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、核磁性质、极化率和超极化率、热力学性质、反应路径，计算可以对体系的基态或激发态执行。

本页目录

作业配置

输入文件	uff.com
软件版本	Gaussian_16A.03
命令	sbatch -N 1 -n 1 -p c-24-4 demo-gaussian.sh
建议硬件	垂头鲨/24核24G/24总核心数

作业提交方式

本软件的作业提交方式有三种，分别为界面提交，命令行提交和Windows工作站提交，三种方式都可以帮你完整的提交运行您的作业。您可以点击下方的tab栏进行切换查看各种提交方式。

命令行提交

Windows工作站提交

导入作业案例

Step 1. 选择软件

Step 2. 选择Gaussian模板。

Step 3. 配置模板参数，传入输入文件。

Step 4. 硬件选择垂头鲨，总核心数为24。

Step 5. 提交作业。

Step 6. 作业结果。可以在下方点击查看结果文件，日志文件等。

点击ssh连接后，进来是一个master节点，创建及连接操作见作业管理节点

在输入文件目录下，创建一个名为gaussian.sh脚本提交作业，命令如下：

#!/bin/bash

export PATH=/public/software/.local/easybuild/software/gaussian/Gaussian_16/g16:$PATH

export g16ROOT=/public/software/.local/easybuild/software/gaussian/Gaussian_16/g16

export PATH=$g16ROOT:$PATH

source $g16ROOT/bsd/g16.profile

export GAUSS_SCRDIR=/home/cloudam/gauss_demo/tmp

export GAUSS_EXEDIR=$g16ROOT

mkdir -p /home/cloudam/gauss_demo/tmp

srun g16 -m=60GB -p=24 </home/cloudam/gauss_demo/uff.com

脚本创建后，我们需要输入命令启动作业，命令如下

sbatch -N 1 -n 1 -p c-24-4 demo-gaussian.sh

其中，-N为节点的数量，这里输入的是1。-n为任务进程数量，这里为1。-p为选择的PARTITION，这里使用的是垂头鲨（c-24-4）。

如上图所示。任务提交成功，jobid为20.

任务提交后，可以查看任务的详情，节点状态等。具体操作见作业管理节点

通过桌面工作站提交，需要创建桌面工作站节点，创建及连接操作见桌面工作站
节点创建成功后，我们就点击连接就可以来到桌面工作站页面。

进入桌面工作站节点后，通过网络，安装执行任务所需要的软件。

我们也可以通过本地电脑向桌面工作站传输文件。点击下方的文件栏，再点击我的电脑。可以看见多个硬盘。本地磁盘c：是当前桌面工作站的硬盘，前面的2个硬盘分布对应了我们本地电脑的c盘和d盘。这样，我们就可以通过简单的移动或者复制，把需要的文件传输到桌面工作站中。

查看作业输出文件

待作业执行完成后，我们可以在多个页面获取到作业的输出文件，详情见查看作业输出文件