界面提交作业
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如果您尚未这样做,则需要注册一个北鲲云帐户。注册后登录到控制台,您将看到一个首页,在首页中选择产品 云超算平台
,同意法律条款后,我们会诚邀您免费预约企业版一对一服务,预约成功即可获得200元算力体验金。然后我们点击提交作业开始创建作业。
要创建新作业,请单击屏幕左侧菜单 云超算平台-提交作业
选择软件
要运行基本作业,我们先需要选择使用的软件,在本案例中,我们使用VirtualFlow来作为本次演示的对象。VirtualFlow是生命科学中的常用软件,旨在利用高性能计算能力并行筛选潜在的有机化合物结构,以寻找有希望的新药物分子。
要找到VirtualFlow
,我们可以在搜索栏中直接搜索到,或者在生命科学
栏目下找到,找到VirtualFlow
后,我们直接点击使用。
软件模板选择
选择完软件后,我们到达到了软件模板选择
页面,这里有我们所选择软件VirtualFlow
的各种模板。模板分为常用模板和社区模板,其中社区模板在高级功能中的社区模板中有详细的描述。
在本次提交中。我们选择使用常用模板。VirtualFlow
的常用模板目前有三种
1,VirtualFlow案例是我们已经配置好了输入文件和相关参数,可以直接进行提交。当然你也可以修改此模板的输入文件和相关参数,直接进行提交作业。。
2,VirtualFlow可视化模板是用户无需使用命令行,直接选择文件输入和配置相关的参数即可提交作业。
3,默认命令行模板适合熟悉命令的用户,可以通过命令行来编辑软件配置,然后进行提交作业的。
在本次提交中,我们点击使用已经配置好的VirtualFlow案例
来直接提交作业。
软件模板配置
在软件模板配置
页面,我们可以看到已经案例模板中的已经配置好的信息和传入文件。
此模块显示为本次作业的输入文件,您也可以直接修改本案例的输入文件,然后上传自己的输入文件。
此模块为本次作业软件的基础配置,在可视化模板中,您可以自定义该基础配置。
此模块为本次作业软件的高级配置,为选填项。
配置好后,我们继续点击下一步。
硬件配置
在硬件配置
页面,我们可以云超算平台支持的多中规格硬件,您可以自由选择硬件规格类型,这里我们选择的是宽吻海豚。
选择完硬件后,我们可以自定义此次任务的总核心数,这里选择的总核心数是4,您也可以定义最长任务执行时间,这里我们默认为0,即不做限制。然后我们点击下一步。
后置处理
后期处理可以输入指定后期处理脚本和后置处理命令,本次任务暂无,故不填。
前面的配置都设置完成,点击下一步 ,页面会显示提交之前的作业摘要。如果一切都令人满意,为作业命名后,请单击“确认提交”按钮以开始执行作业。
作业状态
作业提交成功后,我们会跳转到作业状态页面,此页面监视您的作业状态,如验证输入,启动集群,执行状态等;
允许您实时查看结果文件,日志文件等的内容,这称为实时拖尾文件,对监视工作进度时非常有用。
如果启动节点设置允许公网接入,这可以在查看计算节点的时候通过SSH连接到计算节点查看相关内容。
连接到节点上后,编辑“命令”字段,内容如下:
另外,在作业状态页面,可以看到本次作业运行中的事件告警,作业日志等等,以便监控作业。
计算结果
作业完成后,将显示“ 结果”页面,如下所示,也可在我的云文件中通过输出文件路径找到对应的计算结果